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Most recents (17)
2ème édition : j'ai fait un "2ème kit #Covid_19 " avec quelques publications que je trouvais intéressantes
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quoidansmonassiette.fr/covid-19-analy…
Les nouveautés :
● Mécanisme d’entrée du SRAS-CoV-2
● Affinité au récepteur ACE2 et Structure de la protéine S
#COVID2019france
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quoidansmonassiette.fr/covid-19-analy…
Les nouveautés :
● Mécanisme d’entrée du SRAS-CoV-2
● Affinité au récepteur ACE2 et Structure de la protéine S
#COVID2019france
● Stratégie de contrôle en ISLANDE : TESTS A GRANDE ÉCHELLE
● Stratégie de contrôle à HONGKONG : des mesures prises tôt
● Impact du CONFINEMENT en France sur l’épidémie
● Est-ce que l’épidémie du COVID-19 va revenir ?
● Stratégie de contrôle à HONGKONG : des mesures prises tôt
● Impact du CONFINEMENT en France sur l’épidémie
● Est-ce que l’épidémie du COVID-19 va revenir ?
● Pendant combien de temps le virus est détecté dans les voies respiratoires, le sang, les selles ?
● Obésité : facteur de risque du COVID-19
● Séroconversion et production d’anticorps
● Santé Mentale et COVID-19 : deux enquêtes en ligne
+ des rapports de cas en 🇺🇸🇪🇸🇫🇷🇮🇹🇨🇳
● Obésité : facteur de risque du COVID-19
● Séroconversion et production d’anticorps
● Santé Mentale et COVID-19 : deux enquêtes en ligne
+ des rapports de cas en 🇺🇸🇪🇸🇫🇷🇮🇹🇨🇳
Bonne nouvelle : le confinement a été très efficace avec une réduction du taux de reproduction de base (nombre d'individus contaminés par un individu infecté) de 84%
✅ Résultat : réduction du nombre journalier d’admissions en réanimation de 700 en fin mars à 200 en mi-avril
✅ Résultat : réduction du nombre journalier d’admissions en réanimation de 700 en fin mars à 200 en mi-avril
Illustration du "flatten the epidemic curve"
Le bémol :
Près de 6% des Français devraient avoir été infectés par le SARS-CoV-2, avec une proportion plus importante en Ile-de-France (12,3%) et dans le Grand Est (11,8%)
#COVID2019france
Le bémol :
Près de 6% des Français devraient avoir été infectés par le SARS-CoV-2, avec une proportion plus importante en Ile-de-France (12,3%) et dans le Grand Est (11,8%)
#COVID2019france
Ce niveau d’immunité est très inférieur au niveau nécessaire pour éviter une seconde vague si toutes les mesures de contrôle devaient être levées. En effet, l’immunité collective nécessaire est actuellement estimée à 70%
hal-pasteur.archives-ouvertes.fr/pasteur-025481…
hal-pasteur.archives-ouvertes.fr/pasteur-025481…
🚀 Simulation de la propagation de l pandémie de #COVID2019france entre Mi-Novembre et Mai 2020
🚀 #COVID19 Pandemic simulation with metapopulation GLEAM model (SIR model retrieved from Marlena Siwiak et al. paper)
Full video ⤵️
🚀 #COVID19 Pandemic simulation with metapopulation GLEAM model (SIR model retrieved from Marlena Siwiak et al. paper)
Full video ⤵️
Logiciel utilisé : GLEAMviz
(mettez le son :p)
Illustration du type de modèle dont je parlais dans ma dernière vidéo qui découpe le monde en case habitée de 25km*25km avec 3 300 sous-populations (d'où le méta-population model) et qui utilise les réseaux de transports
#COVID19
(mettez le son :p)
Illustration du type de modèle dont je parlais dans ma dernière vidéo qui découpe le monde en case habitée de 25km*25km avec 3 300 sous-populations (d'où le méta-population model) et qui utilise les réseaux de transports
#COVID19
En image le modèle utilisé. J'ai aussi fait des tests avec des modèles plus simples SIR SEIR
Le bémol de ces simulations est qu'on ne peut pas moduler l'effet du trafic au cours du temps selon les mesures prises par chaque gouvernement + la difficulté d'estimer les paramètres
Le bémol de ces simulations est qu'on ne peut pas moduler l'effet du trafic au cours du temps selon les mesures prises par chaque gouvernement + la difficulté d'estimer les paramètres
[Thread] Depuis le début de l'épidémie du #COVID2019france tout le monde est devenu un peu épidémiologiste. Petite vidéo pour montrer quelques techniques pour étudier la dynamique d'une épidémie et éventuellement faire des prédictions
C'est super bien que les données en libre accès suscite un engouement, mais il y a vraiment beaucoup d'approximations (voire fausses). J'ai vu pleins de gens qui ont essayé de faire passer des fonctions simples (comme l'exponentielle) à travers le nombre de cas
D'où vient cette histoire de croissance exponentielle ?
Ceci n'est vérifié qu'en début d'épidémie. Si on prend un modèle compartimental simple SIR où on divise une population homogène en 3 groupes (avec 3 états)
Les flux entre ces compartiments sont des changements d'états
Ceci n'est vérifié qu'en début d'épidémie. Si on prend un modèle compartimental simple SIR où on divise une population homogène en 3 groupes (avec 3 états)
Les flux entre ces compartiments sont des changements d'états
J'entendais sur @Europe1 que l'#hydroxychloroquine fonctionne parce que la létalité (Case Fatality Ratio CFR) est de 0,7% à l'IHU Marseille/APHM vs un CFR en France plus élevé (~9%) ou dans d'autres pays
La comparaison est compliquée en utilisant le CFR !
#COVID2019france
La comparaison est compliquée en utilisant le CFR !
#COVID2019france
Le CFR varie selon les données et méthodes
Les données de santé publique france (ou Hopkins) vs l'IHU Marseille diffèrent pour calculer le CFR en terme de :
- nombre de personnes testées : plus on teste, plus on a de chance d'avoir un cas, plus le CFR diminue mathématiquement
Les données de santé publique france (ou Hopkins) vs l'IHU Marseille diffèrent pour calculer le CFR en terme de :
- nombre de personnes testées : plus on teste, plus on a de chance d'avoir un cas, plus le CFR diminue mathématiquement
Environ 6% de la population de Marseille a été testée si je prends les données de population de Google (2015)
En France, le % de testé doit être bien plus faible, Santé publique france écrit 28 846 au 31/03/2020
En France, le % de testé doit être bien plus faible, Santé publique france écrit 28 846 au 31/03/2020
Est-ce que les masques chirurgicaux 😷 protègent de la transmission des coronavirus saisonniers et de la grippe du porteur vers l'extérieur ?
✅ OUI répond une étude dans Nature Medicine
nature.com/articles/s4159…
#COVID2019france
✅ OUI répond une étude dans Nature Medicine
nature.com/articles/s4159…
#COVID2019france
"Surgical face masks significantly reduced detection of influenza virus RNA in respiratory droplets and #coronavirus RNA in aerosols. Surgical face masks could prevent transmission of human coronaviruses and influenza viruses from symptomatic individuals"
#COVIDー19 #COVID19
#COVIDー19 #COVID19
j'oubliais un truc important, ça bloque aussi les aérosols contenant des particules de coronavirus !!
Alors qu'habituellement, on/je pensais que ça ne bloquait que les gouttelettes, enfin il y avait une incertitude, d'où l'importance de ce nouveau papier !
Alors qu'habituellement, on/je pensais que ça ne bloquait que les gouttelettes, enfin il y avait une incertitude, d'où l'importance de ce nouveau papier !
C’est peut être une grosse connerie mais...
et si le gvt offrait par exemple 100000 billets d’avions gratuits valable 4 mois pour la France... ça ferait une pierre 2 coup! (Ex via un jeux) #COVID2019france bfmbusiness.bfmtv.com/entreprise/le-… via @bfmbusiness 1)
et si le gvt offrait par exemple 100000 billets d’avions gratuits valable 4 mois pour la France... ça ferait une pierre 2 coup! (Ex via un jeux) #COVID2019france bfmbusiness.bfmtv.com/entreprise/le-… via @bfmbusiness 1)
Du CA dès la fin de la pandémie, puis derrière, les touristes dépenseraient pour hotel, restaurant, etc...
Ca remplirait les avions rapidement dès la sortie de crise et ça reboosterait le secteur touristique par la même occasion! #tourisme #hotellerie #restauration 2)
Ca remplirait les avions rapidement dès la sortie de crise et ça reboosterait le secteur touristique par la même occasion! #tourisme #hotellerie #restauration 2)
Cette solution a le mérite d optimiser l’argent dépensé par l’état car il déclenche automatiquement des rentrées d’argent supplémentaires par derrières... la tout de suite ca me semble être une bonne idée... 3)
Tiens je vais me prononcer sur cette chronique de @NicoMartinFC très critique envers l’article de @tomaspueyo qui a beaucoup circulé. J’ai moi-même partagé l’article de Tomas, mais ce n’est pas pour me défendre que j’écris ça. #Covid_19fr #COVID2019france franceculture.fr/emissions/radi…
TLDR; je pense que Nicolas a raison de dire qu’en tant que journaliste scientifique, il n’a pas à partager ce genre d’articles. Par contre, il a eu tort de le qualifier de "particulièrement trompeur", "ascientifique", "ramassis d'âneries alarmistes".
Ces qualificatifs ne sont appropriés que si vous pouvez juger du fond, or Nicolas ne base pas son avis sur le fond mais la forme : un auteur qui n’est pas épidémiologiste, "des photos anxiogènes d’infirmières sans source" (il n’y a qu’une seule photo et elle *est* sourcée),
Nouvel article de @tomaspueyo (qui n’est toujours pas épidémiologiste mais qui sait toujours lire un graphique 😋) ! Il va pas mal tourner aussi je pense. Je vous le résume mais sa lecture n’est pas difficile. 1/n medium.com/@tomaspueyo/co… #COVID2019france #COVID19fr
D’abord Tomas (et d’autres, article écrit à bcp) abonde dans le sens de l’Imperial College qui pense que la seule stratégie viable c’est la suppression du coronavirus, la mitigation (flatten the curve) est hasardeuse et mortelle. Voir mon autre résumé ici
Nous en France nous sommes déjà dans cette stratégie de suppression mais rappelons que les US et l’UK ne se sont toujours pas décidés à mettre en place une réponse forte de type quarantaine.
🔴 THREAD #COVID19
@GDarmanin regrette ce soir que "trop de Français sont encore dans la rue", mais appelle les ouvriers du bâtiment, les éboueurs ou les postiers à travailler encore.
Quel cynisme. Quelle honte. ⤵️
#coronavirus
#COVID2019france
#JeResteChezMoi
#communication
@GDarmanin regrette ce soir que "trop de Français sont encore dans la rue", mais appelle les ouvriers du bâtiment, les éboueurs ou les postiers à travailler encore.
Quel cynisme. Quelle honte. ⤵️
#coronavirus
#COVID2019france
#JeResteChezMoi
#communication
Qui a prétendu en janvier que le #coronavirus était une forme de grippe qui ne toucherait pas la France ? @agnesbuzyn.
Qui prétendait (en riant) que nous ne fermerions jamais les écoles ? @SibethNdiaye.
Qui disait ne jamais fermer les terrasses des cafés ? @EmmanuelMacron. ⤵️
Qui prétendait (en riant) que nous ne fermerions jamais les écoles ? @SibethNdiaye.
Qui disait ne jamais fermer les terrasses des cafés ? @EmmanuelMacron. ⤵️
De plus, la séquence des #Municipales2020 est un désastre :
demander aux gens de rester chez eux et en même temps (poke) d'aller voter était un contresens que les citoyens n'ont pas compris, créant un mouvement d'inquiétude dans tout le pays.
Un amateurisme confondant. ⤵️
demander aux gens de rester chez eux et en même temps (poke) d'aller voter était un contresens que les citoyens n'ont pas compris, créant un mouvement d'inquiétude dans tout le pays.
Un amateurisme confondant. ⤵️
A propos de trucages de résultats de #DidierRaoult qui lui vaudrait interdiction de publication, recherches préliminaires : #thread 1/n
#COVID19 #COVID2019france #Chloroquine
#COVID19 #COVID2019france #Chloroquine
Dans "Malscience. De la fraude dans les labos" de Nicolas Chevassus-au-Louis, on lit que Raoult publierait trop vite (1252 articles entre 1996 et 2011), aurait une réputation controversée, "reconnaît ne pas relire les manuscrits comportant sa signature
avant soumission" 2/n
avant soumission" 2/n
et aurait été interdit de publication par l’American Society for Microbiology "après la découverte dans un manuscrit soumis par l’équipe de Raoult de figures identiques
supposées décrire des expériences différentes" 3/n
supposées décrire des expériences différentes" 3/n
Je regrette, dénonce et déplore le fait que nos amendements demandant un dépistage systématique aient été jugés irrecevables. #DirectAN #Coronavirus #COVID19 #COVID2019france
Nous sommes dans une crise de la maladie du système économique et social dans lequel nous vivons. Le culte de la main invisible du marché est dangereux et mortel. #DirectAN #Coronavirus #COVID19 #COVID2019france
Le facteur humain est premier. Sécuriser les conditions sociales du peuple et de la production est la première de nos tâches. Les salariés doivent pouvoir se réunir pour déterminer les conditions dans lesquelles il est possible de travailler. #DirectAN
Kit de survie pour s'y retrouver dans les informations scientifiques sur le #COVID2019france
Synthèse grand public des publications scientifiques sous forme de 60 images répondant à une 30aines de questions
quoidansmonassiette.fr/covid-19-analy…
#COVID2019
Synthèse grand public des publications scientifiques sous forme de 60 images répondant à une 30aines de questions
quoidansmonassiette.fr/covid-19-analy…
#COVID2019
Ce pdf essaye de répondre à des questions habituellement posées sur les symptômes chez les adultes, enfants, les masques, le test RT-PC, CT-Scan, les traitements, l’évolution de l’épidémie, comment comprendre les indicateurs épidémiologiques
Analyses phylogénique génomique, états des lieux en terme de nombre de cas et létalité dans le monde, est-ce qu'il y a un effet saisonnier pour les coronavirus ?
#COVID2019france
COMMUNIQUÉ
@JY_LeDrian | @CCastaner | @Djebbari_JB
[ DÉROULEZ LE THREAD ]
Version complète → fdip.fr/yf8uqomt
COMMUNIQUÉ
@JY_LeDrian | @CCastaner | @Djebbari_JB
[ DÉROULEZ LE THREAD ]
Version complète → fdip.fr/yf8uqomt
[ Extrait du communiqué pour les français en déplacement temporaire à l'étranger ]
"S’agissant des Français actuellement en déplacement temporaire à l’étranger, nous leur recommandons en revanche de prendre toutes les mesures nécessaires pour rentrer rapidement en France.
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"S’agissant des Français actuellement en déplacement temporaire à l’étranger, nous leur recommandons en revanche de prendre toutes les mesures nécessaires pour rentrer rapidement en France.
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Pour les y aider, le ministère chargé des transports a demandé aux compagnies aériennes de maintenir au maximum leurs lignes ouvertes vers la France et de modérer leurs prix.
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Face à la pénurie, le gouvernement a commandé en urgence 200 millions de masques "FFP2", indispensables pour protéger les professionnels de santé. Pourquoi la France ne dispose-t-elle que de stocks stratégiques restreints ? Explications. #COVID2019france bastamag.net/masques-chirur…
Olivier Véran affirme le 3 mars que la France a cessé de renouveler ses stocks de masques «FFP2»... depuis 2011 ! A l'époque est pointée la mauvaise gestion de la grippe H1N1: 94 millions de doses de vaccins ont été commandées pour six millions utilisées. ccomptes.fr/sites/default/…
Les subventions de l'Etat versées à l'établissement qui gère les stocks nationaux de produits de santé vont diminuer à partir de 2010. La logique comptable conduit à ce que les stocks de masques FFP2 (périmables) relèvent désormais «des employeurs» (senat.fr/rap/r14-625/r1…).
1er essai clinique #COVID19 pour les antiviraux #Lopinavir-Ritonavir (inhibiteur de protéase) : PAS DE BENEFICE
Pas de différence pour le délai d'amélioration clinique
Délai médian d'amélioration clinique :
Contrôle = 16j
Lopinavir = 16j
RR=1.31 [0.95-1.85]
#COVID2019france
Pas de différence pour le délai d'amélioration clinique
Délai médian d'amélioration clinique :
Contrôle = 16j
Lopinavir = 16j
RR=1.31 [0.95-1.85]
#COVID2019france
En analyse en intention de traiter modifiée, le lopinavir – #ritonavir a conduit à un délai médian d'amélioration clinique inférieur d'un jour à celui observé avec les soins standard
La mortalité à 28 jours était similaire des les 2 groupes (19,2% contre 25,0%)
La mortalité à 28 jours était similaire des les 2 groupes (19,2% contre 25,0%)
Les événements indésirables gastro-intestinaux étaient plus fréquents dans le groupe lopinavir – ritonavir, mais les événements indésirables graves étaient plus fréquents dans le groupe soins standard
[Thread] Colère et tristesse infinie.
Je viens de raccrocher avec mon amie infirmière qui travaille dans une maison de retraite dans l’Oise et a aussi été réquisitionnée dans une unité spéciale Covid-19 en parallèle. Elle bosse donc 6j/7. 1/n
Je viens de raccrocher avec mon amie infirmière qui travaille dans une maison de retraite dans l’Oise et a aussi été réquisitionnée dans une unité spéciale Covid-19 en parallèle. Elle bosse donc 6j/7. 1/n
Cela fait des semaines que ses patients sont malades. Ils ne sont pas testés parce que « ça coûte trop cher » et puis bon, après tout, ce sont des vieux quoi ...
Ils ne sont pas comptés dans les cas officiels 2/n
Ils ne sont pas comptés dans les cas officiels 2/n
et en prévention, aucun moyen de les isoler car il n’y a pas la place.
Chaque jour, ils meurent.
Après que le personnel du service se soit mobilisé en menaçant de ne plus venir travailler, l’hôpital a accepté d’en tester 3 au hasard.
Tous positifs. 3/n
Chaque jour, ils meurent.
Après que le personnel du service se soit mobilisé en menaçant de ne plus venir travailler, l’hôpital a accepté d’en tester 3 au hasard.
Tous positifs. 3/n
